制备色谱是以分离出纯物质为目的的色谱系统，分析色谱是以分析出样品组分信息为目的的色谱系统，基于他们目的的不同，制备色谱相对于分析色谱有很多不同特征，不能简单等同。
当我们在实验室中想得到纳克乃至毫克级的纯物质时，稍微改装下分析型色谱系统就能简单轻松的完成，不过，若所需制备的纯品量很大，此时，再用分析型色谱系统分离纯化，可以预见这将是一场“灾难”。
制备色谱常用的色谱模式有低压，中压，高压三种，以应对不同类型和不同纯度要求的样品的分离，同时尽可能减少成本。
低压：一般而言，低压适合易分离化合物，但分离时间长很容易造成敏感化合物分解。
Flash：Flash是应对低压分离时间长而出现的替代方法，尽管其分辨率不及中压，仍常被用于简单的分离问题。
中压：中压一般采用恒流泵提供恒定的流动相流速，填料颗粒更小，分辨率更高，耐受更高压力和更快流速，同时操作与低压和Flash基本一致，而苏州汇通研发的中压玻璃层析柱，可以完美转接到各类低压和Flash系统，进一步为您节约仪器成本。
高压：高压通常在分离制备的最后阶段采用，应用于分离困难的样品，纯度甚至能达到99.9%。
在开发制备色谱方法时，很多人都存在这样的错误认识，认为制备色谱的流动相纯度不需要优先考虑，分析用色谱纯，制备马马虎虎就行了，不过我们从另一方面思考下，制备过程中流动相的使用量一般都很大，其中的杂质积聚后，对产品的纯度影响将会十分可观，因此，对于杂质的流向需要与纯化过程关联起来，使用纯度较高的流动相是必要的。
制备方法开发案例一：EPA和DHA的中压制备
制备方法开发案例二：葛根植物提取物的中压制备
