企业新建项目在试运行阶段，可能会产生实际的排污行为。根据相关法律要求，企业必须持证排污，不得无证排污。因此，企业在投入运行并产生实际的排污行为之前，应当取得排污许可证。这跟企业是否通过环保验收没有必然的关系。
排污许可证是对企业实际排污行为的许可，根据《建设项目环境保护管理条例》，试生产行为在竣工验收之前，需要试生产的企业，不能等到验收之后才申请许可证。不仅如此，哪怕企业连“试生产”都还没有正式开始，只是在调试阶段，但只要有实际的与生产相关的污染物产生了——即便污染物的类型、排放量跟正常运行之后不一样，企业都必须在此之前获得排污许可证。
此外，企业在申请排污许可证的时候，竣工验收报告并不是前置条件，但是需要提交环评报告的批复文件。
因此，环评是首位的，而申请排污许可证需要在发生实际排污行为之前；而一旦装置运行（试生产、试运行）就会排污，所以排污许可申请需要在环保验收之前完成，且必须已经取得环评批复（或完成登记表备案）。应急预案是投入使用前完成，那么自然是在试运行之前。
综上，可以总结出以下这个流程：环评编制——取得环评批复（或完成登记表备案）——申请排污许可证——编制环境风险应急预案——试运行——开展竣工环保验收——完成自主验收——正式投产。
